Het Nationaal Programma Ruimte voor Defensie (NRD) heeft mogelijk ook gevolgen voor Markelo. Momenteel zijn er in Markelo twee defensieterreinen. Een tankautolaadplaats aan de Petersweg en een pijpleidingdepot aan de Kooidijk. Voor het laatgenoemde terrein moet mogelijk het hekwerk van het depot worden opgeschoven. Als gevolg van aangescherpte veiligheidseisen moet er meer afstand komen tussen de pijpleidingdepots van Defensie en de hekwerken eromheen. Naast de bestaande terreinen is in het NRD ook een nieuwe locatie opgenomen. Het gaat om het gebied tussen de Schipbeek en de provincie Gelderland. Dit gebied wordt in de NRD genoemd als mogelijk nieuw laagvlieg oefengebied voor helikopters.

De gemeente Hof van Twente heeft voor deze laatste locatie een zienswijze ingediend. Ook heeft de gemeente Defensie gevraagd wat het betekent voor inwoners en dieren in het gebied. Naar aanleiding van de zienswijzen en vragen breidt defensie het onderzoek naar de geschikte locatie uit. Zo wordt er gekeken naar de invloed op dierhouderijen en luchtruimgebruikers in de omgeving.

Met Defensie heeft de gemeente de afspraak gemaakt om begin om begin 2025 een informatiebijeenkomst te organiseren. Omwonenden van de locatie aan de Kooidijk worden dan vooraf geïnformeerd over mogelijke veranderingen.